События игры "Вархаммер: Печать Хаоса" происходят во вселенной Warhammer, знакомой геймерам по предыдущим играм этой серии. Её придумал Энтони Рейнольдс, писатель в стиле фэнтэзи. Вселенная представляет собой весьма печальное зрелище. Деревни сожжены, города разрушены, свирепствуют мародёры. Вселенная ослабела после большой войны и великой победы Империи над Хаосом, который снова поднимает голову.

В игре можно выбрать принимают Империю людей, в союзе с эльфами и гномами, любо орды Хаоса со скейвенами и расой крысолюдей. В режиме стратегических перемещений  Вы идёте от одного эпизода к другому по глобальной карте. В некоторых эпизодах Героев и их армии ждут определённые события: города, где можно нанимать новые отряды, бои, за успешное ведение которых можно получить деньги на развитие войска.

Режим тактических сражений позволяет строить собственную уникальную армию. Войска могут различаться опытом, амуницией и духом. Дух уменьшается при нанесении войскам любого повреждения. Когда дух становится минимальным, отряд бросает воевать и спасается бегством.

Всего в игре задействованы 4 армии: Хаос, Империя, Высшие Эльфы, Скавены. Во главе каждой армии стоит Герой, для которого предусматривается несколько вариантов развития событий. Он может сражаться в одиночку или присоединившись к войску, ездить верхом или быть пешим, биться на дуэлях, колдовать, использовать спецприёмы.

В "Вархаммер: Печать Хаоса" войска проходят через города, храмы, арсеналы, казармы, лавка алхимика, которые помогают пополнять отряды, вооружаться, одеваться и т. д.